Normalmente comienzo tratando la zona sacropélvica, luego columna vertebral lumbar, columna vertebral torácica, mandíbula, columna cervical y por último extremidades anteriores y posteriores.
El orden del tratamiento puede variar en función de los hallazgos y el temperamento del animal. En algunos casos es necesario realizar un tratamiento de fisioterapia antes del tratamiento quiropráctico para relajar la zona de tratamiento más complicada por tensiones musculares. En caso necesario se aplicarán técnicas de acupuntura y/o kinesiología. Dependiendo de los hallazgos se procede a la aplicación de vendaje elástico propioceptivo.